Τα κυπριακά προγράμματα είναι χρηματοδοτικά εργαλεία τα οποία προέρχονται εξ ολοκλήρου από τον κρατικό προϋπολογισμό διέπονται από τους κανονισμούς των κρατικών ενισχύσεων και αφορούν κυπριακές προτεραιότητες. Η διαχείριση των έργων γίνεται εξ’ ολοκλήρου στην Κύπρο.